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  • 表观遗传学丨病毒RNA分离快速试剂盒解决方案

    amyjetsci 发布于 2021-01-29 16:25:58

    说到病毒,拿我们现在贼讨厌的新冠病毒COVID-19: SARS-coV-2来举例,它的遗传物质是RNA。如果SARS-CoV-2大流行给我们带来了任何启示,那么对RNA修饰的研究现在比以往任何时候都更加重要。 这是否意味着要研究病毒RNA本身以更多地了解不同的改变和表观遗传学变化如何使这些病毒更具弹性和更具感染力,或者研究从细胞和组织中收集的RNA以了解这些不同病原体对宿主细胞功能的影响,这项研究努力几乎是无尽的。RNA m6A的原理和概念我今日就不再赘述,今天就开门见山的聊聊病毒 RNA m6A.

     

    一 m6A修饰对RNA病毒生命周期的影响

     

    已知表观遗传修饰会影响人冠状病毒等RNA病毒的生命周期。据报道,像N6-甲基腺苷(m6A)这样的修饰腺苷通过调节病毒帽结构、病毒基因表达、病毒子代、先天性感应途径和先天性免疫反应来影响特定RNA病毒的生存能力。m6A的获得或丧失可导致RNA病毒发生显著的功能变化,改变宿主细胞的融合/进入、复制、传播、病原体强度和免疫逃避。宿主细胞的m6A表型组在宿主抵抗力中起着重要作用,病毒感染后也可发生改变。SARS-CoV-2基因组长度超过29800个核苷酸,根据RNA甲基化酶复合物METTL3/14m6A修饰的特定序列座的存在,包括GGACU(T)GGACAGGACC,包含50多个潜在的m6A位点。因此,SARS-CoV-2 RNA>0.64%的腺苷,或0.18%的碱基可能是m6A。因此,总RNAm6A的定量和全转录组m6A图谱的绘制对于研究m6A相关的病毒功能和相应的机制,以及确定新的抗病毒治疗靶点至关重要。

     

    二 病毒RNA提取

     

    无论您是从细胞,组织还是病毒的样品开始,有效的RNA分离通常是成功进行实验的步。对于病毒:另一方面,当涉及病毒样品时,诸如病毒滴度低和污染性宿主核酸的高存在之类的挑战需要使用补充技术来确保产量和纯度符合下游要求。在我们zui近的公告文章中,我们概述了可以完成此操作的10种方法,因此您可以将其应用到zui适合您的学习的方法中。一种方法是接种细胞培养物进行病毒扩增,然后收集扩增的病毒体,以与EpiGentek的病毒RNA提取试剂盒一起使用。注意:对于直接从临床标本中提取的病毒RNA,在m6A RNA富集之前,需要额外的处理以去除共提取的宿主DNArRNA污染物。

     

    三 病毒RNA提取试剂盒

     

    病毒RNA提取产品我们主要有2种:RNA稳健的旋转柱和磁性试剂盒我们的每一个试剂盒都是为了提取高质量的RNA而设计的,除了用于RT-PCR之外,还可以用于其他下游应用。我们的试剂盒在提取方法以及通量选项(高/手动)的类型上有所不同,因此无论您的实验室需要什么,我们的试剂盒都可以帮助您获得随时可用的纯化病毒RNA。我们的各种磁珠和自旋柱试剂盒可以从不同的样品来源(鼻腔/鼻咽拭子、细胞/组织)和物种(病毒、哺乳动物)中分离RNA。洗涤剂和潮解盐用于裂解细胞和灭活RN酶。专门的高盐缓冲系统使RNA碱基与磁珠结合到自旋柱的玻璃纤维基质上,同时污染物被有效地洗去。纯核酸用水缓冲液洗脱,不需要苯酚提取或酒精沉淀。具体操作流程如下:


    11.jpg

     

    货号

    产品名称

    描述

    P-9107
    (旋转柱)

    EpiQuik Viral RNA Isolation Fast Kit

    EpiQuik病毒RNA分离快速试剂盒是一整套优化的缓冲液和试剂,适用于从无细胞液体样本(不包括血浆和血清),特别是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制备病毒RNA。旋转柱法纯化。10min。

    P-9108
    (磁珠法)

    EpiMag Viral RNA Isolation Kit (Magnetic Beads)

    适用于从无细胞液体样品(不包括血浆和血清),特别是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制备病毒RNA,磁珠法,25min。

    P-9109
    (磁珠法)

    EpiMag 96-Well Viral RNA Extraction Kit (High Throughput)

    适用于从无细胞液体样品(不含血浆和血清)中制备磁珠,以高通量方式快速制备病毒RNA。 ),高通量,磁珠法,30min。

     

    结果:

    12.fw.png

     

    Abbexa热门产品研究:https://www.amyjet.com/brand/Abbexa.shtml

  • 牛血清在细胞中的主要运用功能

    实验技术 发布于 2009-11-11 09:38:55

      0. 牛血清是细胞培养中用量最大的天然培养基,含有丰富的细胞生长必须的营养成份,具有极为重要的功能。

      1. 提供对维持细胞指数生长的激素,基础培养基中没有或量很少的营养物,以及主要的低分子营养物。

      2 提供结合蛋白,能识别维生素、脂类、金属和其他激素等,能结合或调变它们所结合的物质活力。

      3.有些情况下结合蛋白质能与有毒金属和热原质结合,起到解毒作用。

      4.是细胞贴壁、铺展在塑料培养基质上所需因子来源。

      5. 起酸碱度缓冲液作用。

      6. 提供蛋白酶抑制剂,使在细胞传代时使剩余胰蛋白酶失活,保护细胞不受伤害。

      牛血清的主要成份

      血清是一种很复杂的混合物,其组成成份虽大部分已为人所知,但还有一部分尚不清楚,而且血清组成及含量常随供血动物的性别、年龄、生理条件和营养条件不同而异。

      1. 蛋白质是牛血清中主要成份。除包括可携带金属离子、脂肪酸和自身是激素类蛋白外主要还有白蛋白,球蛋白。纤维粘连素 细胞促进细胞附着;α2 巨球蛋白 抑制胰蛋白酶的作用;胎牛血清中含胎球蛋白 促细胞附着;转铁蛋白 能结合铁离子,减少其毒性和被细胞利用。

      2.多肽:血小板促生长因子能促细胞分裂,是多肽家庭的主要成员之一,是主要的促细胞增殖因子;成纤维细胞生长因子、表皮细胞生长因子、神经细胞生长因子等,血清中含量虽很少,但对细胞生长也有一定作用。

      3.激素:激素对细胞的作用是多方面的。

      胰岛素:促进细胞摄取葡萄糖和氨基酸,与促细胞分裂有关。

      类胰岛素生长因子:能与细胞表达的胰岛素受体结合,从而有胰岛素同样的作用。促生长激素:促细胞增殖效应。

      氢化可的松:血清中含有定量的该成分,它可能兼有促细胞贴附和增殖作用,但有人证明,血清中的氢化可的松,如细胞密度高时可能有抑制细胞的作用和诱导其发生分化。

      4其他成份:氨基酸、葡萄糖、酮酸等对多种营养成分的合成培养基意义不大。与蛋白相结合状态的微量元素对细胞培养有意义

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  • 建立时间: 2023-04-27
  • 更新时间: 2023-04-27

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