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Small RNA 测序

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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

 技术简介: 
        Small RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条Small RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小RNA,并预测新的小RNA及其靶标基因。 

生物信息分析 
1.   与miRNA 数据库(miRBase)进行比对 
2.   鉴定与重复序列相关的RNA 
3.   对小RNA 序列进行注释分类 
4.   差异表达分析和miRNA 表达谱构建 
5.   小RNA 序列聚类分析 
6.   通过生物信息学方法预测新的候选miRNAs 
7.   将小RNA 定位到基因组上探索其在染色体上的分布特征 

技术优势: 
1、不依赖已知信息:可对任意物种、任意大小、已知或未知的小RNA进行序列测定,可以鉴定已知miRNA,也可预测新的miRNA。 
2、 分辨率高:可检测单个碱基差异,区分相同家族或序列相似性极高的小RNA。 
3、 通量高:可精确检测出几个到数十万个拷贝的小RNA。 

送样要求:

样品 要求
RNA 去蛋白并进行DNase 处理后的完整总RNA
组织 液氮处理,植物 ≥20ug ;动物 ≥10ug ;也可液氮研磨成粉末后加入Trizol (50-100mg 加入1ml Trizol );全血样品需新鲜样品时加入3 倍体积Trizol  LS ,以防止RNA 降解。
浓度 ≥200ng/ul
纯度 OD 260/280 =1.8~2.2 ;RIN ≥8

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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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