药物设计与开发生物信息学       综合运用现代蛋白 质技术等筛选到疾病靶标蛋白质以后，可以合理设计针对疾病靶标特点的先导化合物及其活性类似物。要想得到临床药物，还需要对其进行大规模活性筛选。       在“人类基因组计划”完成后，药物筛选有了很大发展。主要是运用计算机技术，以药物靶标分子三维结构和蛋白质晶体结构为基础，对含有大量化合物结构的数据库进行模拟“筛选”，迅速高效地发现先导化合物及其新用途。这种药物设计的方法是根据靶标分子与药物分子相结合的活性部位的几何形状和化学特征，设计出与其相匹配的具有新颖结构的药物分子。       使用这种方法需建立大量化合物的三维结构数据库，然后将库中的分子分别与靶标分子结合，通过不断优化小分子化合物的位置以及分子内部柔性键的二面角，寻找小分子化合物与靶标大分子作用的最佳构象，计算其相互作用及结合能。在库中所有分子均完成特异结合计算之后，即可以从中找出与靶标分子结合的最佳分子。