微生物酶的应用缺陷
1微生物酶的生产属于微生物发酵的范畴，而应用属于畜牧业的范畴，由于专业间的差异，给酶制剂的管理造成一定困难。至今国内尚无饲料用酶制剂统一标准，各生产单位为了使用方便各自利益，自己制订活力单位、检测标准，给酶制剂质量评定、饲喂应用带来一定的困难，同时也不利于生产工艺的进一步优化和产品质量的提高。
2饲料用酶制剂发酵国内大多采用固体发酵，由于固体发酵生产工艺存在的一些缺陷目前无法克服，造成产品质量不如液体发酵稳定，在生产中(尤其是一些小厂家)有时带入杂菌，给应用带来一定的不利因素。
3饲料加工过程(主要是制粒)中的高温、配合饲料中的重金属离子、动物体内环境等可导致酶制剂失活，因此酶的稳定性是酶应用中的一大问题。应用中应注意对酶制剂进行稳定化处理。此外，筛选优良菌种或通过基因工程技术对菌种实行改造，使之产生的酶能耐高温、有较宽的pH作用范围等抗不良外界条件的性能，也是可供选择的一种好方法。
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