细菌基因组测序
服务简介
随着新一代测序技术的迅猛发展,全基因组测序已经成为细菌基因组研究不可或缺的重要工具。下一代高通量测序技术大大降低了细菌基因组研究的成本,缩短了研究周期,为越来越多的实验室提供了细菌基因组研究的便利。吐露港生物科技采用PacBio平台结合Illumina测序平台,可以提供高效、快速、廉价的细菌基因组完成图。
服务类型
根据不同的研究目的和需求,吐露港提供以下3类服务供选择:
(1)细菌精细图:采用大片段加小片段建库,然后利用Illumina HiSeq2500深度测序和初步的基因组组装策略,性价比高,满足细菌基因组研究基本需求。
(2)细菌完成图:综合利用PacBio RSII(第三代单分子实时荧光测序技术)结合Illumina HiSeq2500深度测序,根据菌株具体情况制定zei优策略,zei终得到一条完整的基因组序列(补齐所有的gaps)。
(3)细菌重测序:针对已知基因组序列的细菌,采用HiSeq深度测序,后续分析不依赖于组装,关注基因组变异情况(包括SNP和InDel等),是群体研究的首选。
服务流程
收费标准
测序项目 |
费用(RMB) |
周期(工作日) |
细菌精细图 |
1.6万(基因组< 5M);2.2万(基因组>5M) |
30 |
细菌完成图 |
3.0万(基因组< 5M);4.5万(基因组>5M) |
50 |
细菌重测序 |
0.2万/1M基因组 |
20 |
数据分析 |
费用(RMB) |
周期(工作日) |
1. 基因预测 |
150(对于选择测序服务客户,免费) |
5 |
2. 功能注释 |
150(对于选择测序服务客户,免费) |
5 |
3. COG分类
(默认COG数据) |
150(对于选择测序服务客户,免费) |
5 |
4. 代谢通路构建
(默认KEGG数据库) |
150(对于选择测序服务客户,免费) |
5 |
5. tRNA、rRNA预测 |
150(对于选择测序服务客户,免费) |
5 |
6. 基因组岛预测
(只针对完成图) |
200 |
5 |
7. 蛋白亚细胞定位 |
200 |
5 |
8. 比较基因组学分析
8.1 SNP分析
8.2 Indel分析
8.3 Pan-genome分析
8.4 基因组结构分析
(8.4只针对完成图) |
600 |
5 |
9. 次生代谢基因簇分析
(只针对完成图) |
400 |
5 |
10. 基因组圈图绘制
(只针对完成图) |
400 |
5 |
11. 进化树分析
(客户提供≥2个参考基因组链接) |
200 |
5 |
注明:
对于所有数据分析(单选或全部),均在5个工作日内完成。
微生物全基因组测序价格
微生物全基因组测序信息由上海吐露港生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于微生物全基因组测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。