基于DNA共甲基化模块筛选食道癌生存预后相关的基因及构建预后预测模型-价格-分析测试百科网服务谱

r 数据A. TCGA食道癌Methylation数据、mRNA数据（训练数据集，主分析数据集）B. GEO数据库中的食道癌数据（验证数据集）r 分析提纲1. 保留具有临床信息（尤其是临床预后

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型号：基于DNA共甲基化模块筛选食道癌生存预后相关的基因及构建预后预测模型
品牌：研载生物
产地：中国

研载生物科技（上海）有限公司

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型号	品牌	PIPES指数
鹿明生物多层组学实验与数据分析专业培训	鹿明生物	8.1
转录组测序分析	智预生命	5.0
		5.0

r 数据

A. TCGA食道癌Methylation数据、mRNA数据（训练数据集，主分析数据集）
B. GEO数据库中的食道癌数据（验证数据集）
r 分析提纲
1. 保留具有临床信息（尤其是临床预后信息）的食道癌样本Methylation数据，并进Tumor VS.Control组间显著差异的甲基化位点的筛选，得到类似如下的结果：
图片1.png

对筛选得到的DMG（Differentially methylated Genes）的注释。
2. 对所有检测得到的甲基化cg位点（有对应到相应位置的基因的位点）进行WGCNA的co-methylated 模块的筛选。
图片2.png

3. 将筛选得到的DMGs mapping到每个划分得到的模块中，对DMGs在模块中的performance进行hypergeometric-based tests，研究DMGs显著地富集出现在哪一些疾病相关的模块中，得到如下图的结果：
图片4.png

4. 选取DMGs显著出现的模块及其中的methylation genes进行BP和KEGG通路的分析，如下图：
图片5.png

5. 在配对的Methylated seq和mRNA-seq样本中计算methylation和expression水平的相关性，并计算每个DMGs的methylation和expression水平的相关性，结果如下图：
图片6.png

保留methylation和expression水平呈负相关关系的DMGs进行进一步分析
6. 对前一步中筛选得到的负相关的DMGs进行单因素cox回归分析，筛选预后显著相关的DMGs，并进行优化组合选择，得到类似下图的结果：
图片7.png

7. 基于zuiyou DMGs组合进行预后风险模型构建，并验证
图片9.png

8. 对筛选得到的重要DMGs进行methylation和expression水平与预后间关联性分析，得到类似如下的配对图：
图片10.png

基于DNA共甲基化模块筛选食道癌生存预后相关的基因及构建预后预测模型价格

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​基于DNA共甲基化模块筛选食道癌生存预后相关的基因及构建预后预测模型(研载生物)

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基于DNA共甲基化模块筛选食道癌生存预后相关的基因及构建预后预测模型(研载生物)